花椰菜较耐低温，适宜的贮藏温度为0～1℃，相对湿度以95%左右为宜，如湿度偏低或通风量过大，花球失水萎蔫、松散，品质变差。在低氧（2%以下）、高二氧化碳（5%以上）环境中引起生理失调，花球出现类似煮后的症状，并产生异味而失去食用价值。机械伤害也会加速衰老变质。
       品种选择、栽培要求及采收
        用于贮藏的花椰菜宜选择花球紧实、品质好、耐热或抗寒、适应性强的中、晚熟品种。春季可选用福农10号、瑞士雪球，秋季可选荷兰雪球等。
        栽培中在加强水肥管理的同时，尤须注意磷钾肥的合理施用，这不仅能促进花球良好发育，还可防止因缺钾肥而发生黑心现象。花椰菜对硼等元素也很敏感，缺硼会导致花球开裂，严重时变褐色，产生苦味。缺硼的土壤要注意硼肥的施用。
       采前措施：花球刚露出时，将花球周围的叶片拢起，用草绳等轻轻捆扎，或者将花球附近的1～2片叶折断，覆盖在花球上，以保持花球的洁白柔嫩。采前4～5天停止灌水。
采收标准：花球裸露，含水量较高，质地脆嫩时即可采收。采收时要小心操作，轻摘轻放，选择充分长大，表面圆正，边缘花蕾未散开的花球，一般在下午4：00～5:00采收，白花球下留2～3轮叶片处割下，如用于假植贮藏，要连根带叶采收。雨天不宜采摘。
　 预贮措施
1.挑选整修选择直径15cm左右、结球紧实、洁白、无病虫害、无机械伤的花球，留3～5片叶，并切除下部过老的花茎。
2.防腐处理贮前可用0.15%托布津溶液浸蘸花球蒂部（不可浸入至花球）或用克霉灵保鲜剂（其主要有效成分为仲丁胺）挥发熏蒸，方法是每kg花椰菜用0.lmg克霉灵保鲜剂浸沾在吸水性好的纸或棉布条上，均匀地挂在菜垛四周或垛与垛之间，熏24小时即能抑制菜体表面的病原菌。对窖、库体以及包装物件、架材等用0.5%的漂白粉液喷洒或用克霉灵保鲜剂在密封条件下熏蒸消毒灭菌。
3.预冷可采取自然气温下预冷，将待贮产品及时置于阴凉通风处，白天遮荫、夜间敞开。如有冷库可先将库温渐降至4～5℃，启用通风设施快速降低菜体温度。此法快而稳定，效果尤佳。
   贮藏方法
1.假植贮藏冬季不十分寒冷的地区，可利用阳畦、简易贮藏沟假植贮藏。立冬前后将尚未长成的小花球连根带叶挖起，假植在阳畦或贮藏沟中，行距25cm，根部用土填实，再把植株的叶片拢起捆扎好，护住花球。假植后立即灌水，适当覆盖防寒，中午温度较高时适当放风。进入寒冬季节，加盖防寒物，并视需要灌水。假植区域内的小气候温度前期可高些，以促进花球生长成熟。至春节时，花球一般可长至0.5kg。该法经济简便，是民间普遍采用的贮藏方式。
2.菜窖贮藏经预处理后的花椰菜装筐至八成满，入窖码垛贮藏，垛的高度随窖高度而定，一般4～5个筐高，须错开码放。垛间保持一定距离，并排列有序，以便于操作管理和通风散热。为防止失水，垛上覆盖塑料薄膜，但不密封。每天轮流揭开一侧通风，调节温、湿度。贮藏期间须经常检查，发现覆盖膜上附着凝聚水要及时擦去，有黄、烂叶子随即摘除。应用该法贮期不宜过长，20～30天为好。可用于临时吞吐周转性短期贮藏。
3.冷库贮藏
   （1）自发气调贮藏在冷库中搭建长4.0～4.5cm、宽1.5m、高2.0m左右的菜架，上下分隔成4～5层，架底部铺设一层聚乙烯塑料薄膜作为帐底。将待贮花球码放于菜架上，最后用厚0.023mm聚乙烯薄膜制成大帐罩在菜架外并与帐底部密封。花椰菜自身的呼吸作用，可自发调节帐内的氧与二氧化碳的比例，但须注意氧不可低于2%，二氧化碳不能高于5%。控制方法：通过启开大帐上特制的“袖口”通风（简称透帐）。贮藏最初几天呼吸强度较大，须每天或隔天透帐通风，随着呼吸强度的减弱，并日趋稳定，可2～3天透帐通风1次。贮藏期间15～20天检查1次，发现有病变的个体应及时处理。为防止二氧化碳伤害，在帐底部撒些消石灰。在菜架中、上层的周边摆放一些高锰酸钾载体（用高锰酸钾浸泡的砖块或泡沫塑料等）吸收乙烯，贮藏量与载体之比是20∶1。大帐罩后也可不密封，与外界保持经常性的微量通风，加强观察，8～10天检查1次。以上方法可贮藏50～60天，商品率达80%以上。
   （2）单花套袋贮藏用0.015mm厚的聚乙烯薄膜制成长、宽分别为40、30cm（或根据花球大小而定）的袋子。将备贮的花球单个装入袋中，折叠袋口，再装筐码垛或直接码放在菜架上贮藏。码放时花球朝下，以免凝聚水落在花球上。这种方法能更好地保持花球洁白鲜嫩，贮期达3个月左右，商品率约为90%。此法贮藏效果明显优于其它贮藏方式，在有冷库地区可推广应用。应用此法须注意的是花椰菜叶片贮至两个月之后开始脱落或腐烂，如需贮藏2个月以上，除去叶片后贮藏为好。